DNA樣本經(jīng)過亞硫酸氫鹽處理后,用PCR擴增目的片段,并對PCR產(chǎn)物進行測序,將序列與未經(jīng)處理的序列進行比較,判斷CpG位點是否發(fā)生甲基化。操作方法可靠,且精確度高,能明確目的片段中每一個CpG位點的甲基化狀態(tài)。
技術(shù)簡介
DNA甲基化是最早發(fā)現(xiàn)的基因表觀修飾方式之一,真核生物中的甲基化僅發(fā)生于胞嘧啶(C),即在DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶(DNMTs)的作用下使CpG二核苷酸5’端的胞嘧啶轉(zhuǎn)變?yōu)榧谆奏?。DNA甲基化通常抑制基因表達,去甲基化則誘導了基因的重新活化和表達。這種DNA修飾方式在不改變基因序列前提下實現(xiàn)對基因表達的調(diào)控, 這種DNA修飾的方式在脊椎動物的胚胎發(fā)育過程中起著重要的調(diào)控作用,參與多種疾病包括各種腫瘤的發(fā)病機理,是目前表觀遺傳學研究的熱點。
以重亞硫酸鹽處理基因組DNA,發(fā)生甲基化的胞嘧啶不變,而未甲基化的胞嘧啶會變成尿嘧啶,經(jīng)過PCR擴增,原本的C/G就變成T/A,可以通過測序區(qū)分。
DNA甲基化檢測實驗流程長,操作煩瑣,不易控制;亞硫酸氫鈉處理、DNA定量、PCR引物設(shè)計、PCR擴增條件的選擇都需要非常豐富的實驗經(jīng)驗。
適用領(lǐng)域
DNA甲基化是最常見的復制后及轉(zhuǎn)錄后修飾方式之一,在基因表達調(diào)控、發(fā)育調(diào)節(jié)、基因組
印跡等方面發(fā)揮重要作用,當前熱門的應(yīng)用有:
1. 基因甲基化與單親遺傳病
2. 基因甲基化與單親遺傳病
3. 基因甲基化與老化
服務(wù)內(nèi)容
服務(wù)流程
樣品與實驗結(jié)果
實驗結(jié)果示例